SPSSS如何实现哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinbergequilibrium)法则检验
2018年1⽉19-21,安徽合肥
缘起
“哈迪-温伯格定律”是指在理想状态下,各等位基因的频率和等位基因的基因型频率在遗传中是稳定不变的,即保持着基因平衡。该定律运⽤在⽣物学、⽣态学、遗传学。然⽽在⼤家常⽤的SPSS中,没有直接⽤于分析的模块,特为⼤家准备此⽂。
1.实战演⽰
金秀贤裴勇俊消息回复红⾊部分:“hardy”,拿Hardy Weinberg 检验程序。
2.背景知识
遗传平衡定律(⼜称Hardy Weinberg定律)。意即⼀个体符合这种状况,即达到了遗传平衡,也就是⼀对等位基因的3种基因型的⽐例分布符合公式:p2+2pq+q2=1,p+q=1,(p+q)2=1.基因型MM的频率为p2,NN的频率为q2,MN的频率为
恰组词是什么2pq。MN:MN:NN=P2:2pq:q2。MN这对基因在体中达此状态,就是达到了遗传平衡。如果没有达到这个状态,就是⼀个遗传不平衡的体。但随着体中的随机交配,将会保持这个基因频率和基因型分布⽐例,⽽较易达到遗传平衡状态。
弦子 迪克牛仔应⽤Hardy-Weinberg遗传平衡吻合度检验⽅法,把计算得到的基因频率代⼊,计算基因型平衡频率,再乘以总⼈数,求得预期值(e)。把观察数(O)与预期值(e)作⽐较,进⾏χ2检验。病例组和对照组的基因型分布的观察值和预期值差异⽆显著性(P>0.05),符合遗传平衡定律:for example,下表为⼀个具体的Hardy-Weinberg遗传平衡检验
基因型数⽬(⼈)基因型频率
CC 55 28.7%afp金融理财师
CT 103 53.6%
网红abbily转性成功TT 34 17.7%
等位基因C的发⽣频率为:28.7%+53.6/2%=55.5%
卡戴珊20分钟完整版等位基因T的发⽣频率为:17.7%+53.6/2%=44.5%
根据Hardy-Weinberg定律,P2+2pq+q2=1
则基因型CC的理论值数⽬是:0.555*0.555*192=59
基因型TT的理论值数⽬是: 0.445*0.445*192=38
基因型CT的理论值数⽬是: 2*0.555*0.445*192=95
X2=∑(A-T)2/T=(55-59)2/59+(34-38)2/38+(103-94)2/94
=1.4174
按⾃由度=2,查X2界值表,P>0.05,因⽽不能认为这两组数据有显著性差别,也即该样本达到了遗传平衡。
其实Hardy-Weinberg检验,⽤的就是检验的卡⽅检验的⽅法,因为简单,所以软件并没有将其作为固定的算法或模块加⼊。
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