DPABI(⽤于脑成像的数据处理和分析的⼯具箱)的下载和安装步骤，请参阅博客：
DPABI版本：V4.3_200401
MATLAB版本：2018a
⽬录
⼀、数据准备
（1）如果是数据的DICOM格式，整理成以下格式（注意⽂件夹的命名⽅式）：
（2）如果数据是nii格式，整理成以下格式：
按照nii的⽂件格式进⾏整理，整理结果如下：
注意： 我的fMRI数据在⼀开始都是4D的格式，结果发现在预处理途中会出现以下报错，后来把4D的格式全部转成3D的nii格式后解决问题。严⽼师在视频中说4D-nii格式也是可以接收的，但在预处理的时候还是会出问题，具体还不清楚什么原因，因此建议把fMRI 数据全部转换为3D-nii格式，或者直接从DICOM格式开始处理，这样可以避免以下报错。
⼆、预处理
在MATLAB中输⼊“dpabi”，回车，会陆续出现以下界⾯，陆续点击DPARSF 5.0→DPARSF Advanced Edition，即会出现DPARSF 处理界⾯。
⾸先需要输⼊整理好的数据，操作流程如上图所⽰：
①选择同时包含FunImg和T1Img数据的总⽬录
②输⼊数据的Time Point和TR（Time Point就是fMRI的volume数）
③如果输⼊的是DICOM数据，则勾上；如果直接输⼊nii数据，则把勾去掉
④填写下⾯的Starting Directory Name：如果输⼊的是****DICOM*数据，这⾥不⽤改，FunRaw就是开始执⾏程序的⽂件夹；如果输⼊的是nii数据，开始执⾏⽂件要改成FunImg*，然后回车，后⾯会弹出⼀些提⽰，看看直接跳过即可。
蓝⾊框框处是Template parameter，也就是处理流程的模板，⼀般直接⽤默认的就可以，不⽤动，这⾥也直接使⽤默认处理流程。后⾯会专门介绍⾥⾯每个处理流程有什么区别。下图是成功输⼊nii数据后的界⾯：
如果成功输⼊数据，在Participants框框⾥⾯会⾃动读取被试个数，如果没有成功读取，可以检查⼀下上⾯的四个步骤，尤其是下⾯的Starting Directory Name有没有填错。
下⾯是对每个预处理功能的介绍，由于DPARSF排版⽐较密集，下⾯将分开4⼤部分来做笔记。
PART 1
①Remove first 10 time points 必填
被试进⼊磁共振扫描时，梯度磁场的稳定需要⼀段时间，被试适应也需要⼀段时间，因此前⼏个时间点的图像噪声较多，通常选择去除4个时间点以上，默认是去除前10个。
②Slice timing 必选
层时间矫正。对⼤脑进⾏扫描时⼀般采⽤隔层扫描的⽅式，如先扫1，3，5，7，9层，再扫2，4，6，8，10层，也就是第1、3层的扫描时间⽐较早，⽽第2层的扫描时间⽐较晚，因此同⼀脑区的扫描时间差异较⼤，需要⽤⼀些⽅法把它们矫正到同⼀时间点扫描，这就是Slice timing。
③Slice number 必填
总的层数，根据⾃⼰实验数据的基本信息填写。
④Slice order 必填
扫描顺序，根据⾃⼰实验数据的基本信息填写，然后按照matlab的矩阵表达⽅式输⼊即可。
怎么做数据分析如扫描顺序是：1，3，5，7，9，11，13，2，4，6，8，10，12，则输⼊[1:2:13,2:2:12]。
（要留意是先扫奇数层还是先扫偶数层，如西门⼦机器的设置：若总层数是奇数时，会从奇数层先开始扫描，如总层数为33，扫描顺序为1，3，5，……，2，4，6，……；若总层数是偶数时，则会从偶数层先开始扫描，如总层数为32，扫描顺序为2，4，6，
……，1，3，5，……）
⑤reference slice 必填
参考层，⼀般选择最中间那⼀层作为参考，如扫描层数是：1，3，5，7，9，11，13，2，4，6，8，10，12，参考层则为13（总层数为偶数时可以选择中间任意⼀层作为参考层）。
⑥Realign 必选
头动矫正。在实验过程中被试会有⼀定的头部运动，需要⽤⼀些算法进⾏头动矫正。做完这⼀步后，头部运动的结果会保存在RealigParameter⽂件夹下。
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