怎么分配？应缴纳哪些税金？
以下仅是本人工作实践过程中的一些经验，如果的比较复杂的股权变更最好是咨询专业机构，多和税务局/工商局沟通。一定要了解清楚后再去进行相应的股权变更操作，一旦做了这个动作就可能要涉及到缴纳个税，我们公司就吃过这个亏，哎。
一、对公司进行增资
增资扩股的收益主体为公司，是新股东将投资款项直接汇到公司资金账户上，并没有与任何股东发生直接或者间接的财产上的联系，其资金成为注册资本的部分，公司注册资本会增加。
1、按照估值来计算股权比例，举例：甲有限责任公司注册资本100万，A股权占比60%，B
怎么新公司注册股权占比40%，目前公司估值400万，C注资100万，那新股东股权占比20%，A股权占比：60/125=48%，B股权占占:40/125=32%。
假定C投入的100万在甲公司的体现的实收资本为X，则：X/(X+100万)=20%，解得：X=25(万元)，则变更后公司的注册资本为125万，C注资的会计处理如下：
借：银行存款 100万
贷：实收资本——股东C 25万
资本公积——资本溢价 75万
2、当然在实际操作过程中一般公司估值很难确定，股权比例一般按照股东协商分配。毕竟后期注资的股东本身已经躲过了企业风险最高的阶段，注资后，是否参与到公司的管理与运营中都是股权分配时需要考虑的关键因素。因此股东协商决定分出合理的股权给予投资人也是非常实用的一种手段。举例：甲有限责任公司注册资本100万，A股权占比60%，B股权占比40%，C注资100万，约定股权占比25%。
假定C投入的100万在甲公司的体现的实收资本为X，则：X/(X+100万)=25%，解得：X=33.33(万元)，则变更后公司的注册资本为133.33万,变更后A股权占比=60/133.33=45%，B股权占比=40/133.33=30%。C注资的会计处理如下：
借：银行存款 100万
贷：实收资本——股东C 33.33万
资本公积——资本溢价 66.67万
3、增值扩股的税金缴纳
按照税法理解，企业增资扩股而导致原股东持有的股权比例自然稀释，并不属于股东转让股权而造成；虽然被投资企业资本公积有所增加，但企业并未对股东进行分配或将资本公积转增股本，是不涉及缴纳个人所得税的，但是有些地区税务局对低于公允价格增资扩股，认为存在稀释股权的行为，则增资扩股的股东实际获得的股权份额比其应获得的股权份额多，而不增资股东其应获得的股权份额比其实际获得的股权份额少，减少了股权份额，存在低价转让股权行为，需要缴交个人所得税。（原来A股权占比60%，B股权占比40
%，公司净资产为600万，如果C新股东投资100万，约定C股权占比20%，A股权占比48%，C股权占比32%，对于C 100<600*20%,这就是低价转，让，A、B都要就净资产价值发生转移的部分缴纳个人所得税）。
实际情况中一定多和当地税务局沟通，因为有些地区税务局可能对增值扩股行为直接认定为要缴纳个人所得说，了解清楚再行动。
需要缴纳万分之五的印花税。
二、公司现股东转让部分股权给新股东
股权转让的收益主体为转让股权的股东，转让资金实则是股权的对价，是转让股东与受让股东双方当事人的一场特定交易。股权转让是股东行使股东权利的一种手段，是股权市场流通和优化资源配置的一种方式，只涉及到受让方与转让方双方的民事法律行为，产生的法律效力也是原股东退出公司内部，由受让方继受其权利义务；与公司无利益上的关联，不会导致公司注册资金的增加。
（1）、关于个人股权转让：
1、印花税《中华人民共和国印花税暂行条例》的规定，股权转让合同的印花税，应按“产权转让书据”以合同载明的股权转让金额的0.05%计算缴纳。且印花税没有代扣代缴义务人，由双方各自完成。由转让双方各自缴纳，自然人在增值税纳税人类型上，同小规模纳税人，可享受50%的税额幅度内减征。
2、个人所得税转让方缴纳个人所得税。应纳税额=（转让股权收入-取得该股权所发生的成本-转让过程中所支付的相关合理费用）×20%。并且转让股权转让方应缴纳的个人所得税，由受让方作为代扣代缴义务人缴纳个人所得税。
注意：自然人股权转让个人所得税的申报地点在股权变更企业所在地。
三代以内直系亲属转让需要缴纳税费吗？1.印花税无论是无偿转让还是有偿转让都应当缴纳印花税，按照《中华人民共和国印花税暂行条例》的规定，在中华人民共和国境内领受本条例所列举凭证的单位和个人，都是印花税的纳税人，都应当缴纳印花税，直系亲属在股权转让中以股权面值为依据0.05%计算缴纳，可享受50%的税额幅度内减征。
（2）、关于企业股权转让：
1、企业所得税如属于企业股权转让，企业股东转让股权，还要申报缴纳企业所得税。转让方为法人时，以取得股权转让收入的企业为纳税人申报缴纳企业所得税。
具体税率根据情况有所区别，一般企业所得税税率为25%，符合条件的小微企业税率为20%，国家重点扶持的高新技术企业税率为15%。对于未在境内设立机构的非居民企业，需要按规定缴纳企业所得税，税率为10%。
2、印花税股权转让的双方要按万分之五税率缴纳印花税。股权转让双方都要按照实际成交额缴纳印花税。印花税是在签订了转让合同之后，双方去企业驻地地方税务局缴纳，凭完税证去工商局办理股权变更手续。
3、增值税只有企业转让上市公司的股权才需要按照金融商品转让缴纳相应增值税。而金融商品转让的增值税税率，一般纳税人为6%，小规模纳税人为3%。
4、土地增值税如转让的股权主要是土地使用权、地上建筑物及附着物的，要征收土地增值税
可能有些人会说那我平价转让就不用缴纳所得税了吧，当然不行，如果转让收入低于股权
对应的净资产份额，有可能被认定为股权转让价格明显偏低，税务局是不认可的，所以还是需要根据公司的具体情况来。
综上，股权结构变化会对公司方方面面产生很大的影响，大家应该谨慎处理。
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