1、人力风险：网店经营貌似在时间上很自由，其实还没有上班轻松自在。除非熬到冠级，可以轻松雇佣客服人员为店主分忧。更多的中小网店卖家利润不足以支撑客服薪酬的，只能自己亲历亲为，从进货，拍照，上货，销售，快递，售后等一条龙工作全由自己完成，网店经营的艰辛只有中小卖家深有体会。 
2、货源风险：好的货源是成功的关键，到特货源，通过人脉渠道，拿到物美价廉的好货十分重要。但也只是万里长征的第一步，所售商品如果正赶上销售旺季，货源是否有保障。断货、断码等情况出现怎么应对，没有补货，库存不清楚，何时能上货，是否能一一对答如流，解释周全。充足稳定的货源是每个网店卖家经营的根基，而拼抢渠道，竞争激烈，一切皆有可能发生。做好足够的准备，及时掌握库存，稳定货源供应非常重要。 
3、成本风险：网店省却了实体店的店租以及地面推广发花费，新增了包装、网费、电费等，如果卖家注重细节营销，一些附加包装成本便上来了。小店刚经营时，总是要绞尽脑汁做推广的，以淘宝网为例，网店推广产品多多，只要肯花
钱，都可以一一尝试。至于效果如何，还需要在摸着石头过河中寻最适合自己的路径，达到最好推广效果。
4、物流风险：物流在用户体验中十分关键，客户往往会以快递的服务来直观感知网店服务好坏，虽然这不一定科学，快递往往是网店买家没有能力控制的最后一公里。有的掌柜的觉得我把东西卖出去了，客人收到货付款了交易完成就OK了。但是我们有没有想过客人是在买到东西后几天内收到的呢，东西有没有破损、丢失呢，有没有达到客人预想的结果呢？比如北京暴雨，与店里合作的快递员家中有事没能上班，结果快递公司总部派其他快递员来取件，因为道路不熟，业务较多，以致取货时间被延迟，店主被买家质问N多回，很是伤神。 
5、售后风险：网店因为缺乏实体店的支撑所以口碑十分重要，反应到数据上就是好评率的多少，好评率的高低会直接影响新用户的购买决定。也许你自信满满，待人真诚，商品质量可信，稳扎稳打的苦心经营着网店。但林子大了什么鸟都有，周到的服务也许还是被中差评了。怎么办？或者郁闷的碰到差评师。当100%好评被打破时，是否可以弱化影响，继续热血奋斗于网店卖家中而做到对这种另类真正漠视或无视，依旧做最好的自己？这绝对是种心理素质的挑战。
（一）运营问题 
目前网店经营主要面临运营困难问题，店铺没流量，没顾客访问，信誉低的问题。这是制约
店铺发展最头痛的问题，目前淘宝所处的竞争状态已经不是03年了，现在竞争电子商务的发展已经处于白热化，后兴起的网上商城团购站，都给淘宝网造成了很大冲击。如果你个人不懂运营，劝你还是不要开网店了，运营需要团队。只有一个运营的团队，才会在这么一个竞争激烈大环境种展露头角，吃淘宝这碗饭。这是一个新手想入网店这行首先需要明白的。所以我建议采用，多种运营手段对前期店铺的宣传。  比如说：淘宝直通车，钻石展位，淘宝客，参加活动等，如果你觉得你的产品很有优势的话，你也可以参加百度推广，进行品牌宣传。 
（二）运营规则问题     
新手怎么开网店任何一个平台都有它运行的规则，网店这行也一样。你如果想做淘宝，首先要做的就是熟知它的规则，如果你不知这个平台的规则你则会在运营中受阻。下面我将简单列举几项淘宝的规则。商品主图注意事项虚假交易规则、违背承诺新规则、按约定时间发货规则、店铺常见违规扣分、淘宝发布违禁信息规则、七天无理由退换货、淘宝排名规则。等等只有你了解了这些规则，你的淘宝运行才会有一个很好的发展。
（三）支付问题   
传统的交易中个人购物时支付手段主要是现金, 即一手交钱一手交货, 双方在交易过程中可以面对面地进行沟通和完成交易。网上商店的交易是在网上完成的, 交易时交货和付款在空间和时间上是分割的, 消费者购买时一般必须先付款后送货, 付款时可以用网上支付系统完成网上支付。网上支付系统包括四个主要部分: (1) 电子钱包; (2) 电子通道; (3) 电子银行; (4) 认证机构。网上支付系统是一系统工程, 它需要银行、商家、消费者和信息技术企业的共同参与, 系统中缺少任何一个环节都无法正常运行。由于网上商店面对的是千千万万的个体消费者, 要将这些消费者纳入电子支付系统是比较困难的, 一方面它要求个体消费者必须有良好的信用, 另一方面消费者对网上支付的安全隐私存在顾虑。可见消费者对电子支付认识和接纳有一个比较长过程。因此, 目前电子支付面临的最大问题是引导和教育消费者对电子支付认识和认同。
（四）安全隐私问题 
传统购物交易是匿名进行的, 购买者不用表露自己身份, 购物时完全可以保护自己隐私而且有一种安全感。随着信用卡普及推广, 消费者购买时可以不必携带现金只刷卡即可,但交时卡和密码由购买者自己保管, 购买时消费者还是可以控制交易过程, 感觉比较安全。而在网上商店
进行网上购物时, 消费者面对的是虚拟商店, 对 产品的了解只能通过网上介绍完成, 交易时消费者需要将个人重要信息如信用卡号、密码和个人身份信息通过网上传送。由于Internet 的开放性, 网上信息存在被非法截取和非法利用的可能, 存在一定的安全隐患。同时, 在购买时消费者将个人身份信息传送给商家, 可能被商家掌握消费者的个人隐私, 有时这些隐私信息可被商家非法利用, 因此网上交易还存在个人隐私被侵犯的危险。随着技术发展和网上交易规范, 现在出台一系列的网上交易安全规范如SET 协议, 它通过加密技术和个人数字签字技术, 保证交易过程信息传递的安全和合法, 可以有效防止信息被第三非法截取和利用。
（五）物流配送问题       
传统商店购买时现款现货, 消费者限于地理位置限制购买时一 般就地选择购买, 货物的运送一般比较简单而且可以当天完成。而在网上商店的购买者可能是世界上任何一个地方的网民, 这时货物的配送和运输就是一个非常关键的问题, 如果运输时间太长, 就可能让消费者失去耐心, 另一方面, 如果运输费用过高则可能抵销网上商店带来的价格优惠, 因此建立高效可靠的配送体系是保证网上商店发展的前提。      目前, 网上商店销售产品最多的是信息类产品和小件商品, 这是因为信息类产品如软件、音乐等可以直接通过Internet 传送, 无须运输, 而小件商品由于便于运输而且运输损伤风险比较小, 容易
被消费者接受。我国网上商店在这方面受到很大制约, 到目前为止, 国内依然缺乏系统化专业化的全国性货物配送企业, 单件商品的长途运输或者邮递的巨大成本以及时间上的延迟足以使消费者望而却步, 更不用说未来的农村市场, 因此扶持和发展我国的专业配送企业迫在眉睫。