增值税专用发票抵扣联是企业进行增值税抵扣的重要凭证之一，它记录了企业所购商品或接受的服务的相关信息，包括销售方名称、纳税人识别号、商品或服务名称、金额等重要内容。然而，在实际操作过程中，有时候不可避免地会发生抵扣联丢失的情况。那么，当增值税专用发票抵扣联丢失时，我们该如何处理呢？
首先，我们需要明确的是，增值税专用发票抵扣联丢失是一种比较常见的情况，发生这种情况并不意味着企业失去了抵扣的权利。根据《财政部、国家税务总局关于落实增值税政策有关问题的通知》（财税〔2019〕13号），企业在遇到增值税专用发票或其抵扣联丢失时，应采取以下措施：
第一，及时补开增值税专用发票。在增值税专用发票或其抵扣联丢失后，企业应尽快联系销售方或服务提供方，向其申请补开增值税专用发票。补开增值税专用发票的内容应与原发票一致，但在发票号码上需要注明“补开”。同时，为了确保税务机关核准补开的增值税专用发票的真实性和合法性，企业还需要提供相关证明材料，如购货合同、付款凭证等。在补开增值税专用发票过程中，企业应主动与销售方或服务提供方进行沟通，确保补开程序的顺利进行。
如何开增值税发票第二，按规定记录、归集丢失的增值税专用发票。对于丢失的增值税专用发票，企业应按照一般纳税人和小规模纳税人的规定，依法并按照规定的期限填写纳税申报表，保留抵扣时使用的复印件或扫描件。同时，企业还应当将丢失的增值税专用发票情况记录在企业内部的账册或单据上，以备将来的查验与核对。
第三，提供相关证明材料备查。为了确保抵扣的合规性，企业还需要提供相关的证明材料备查。这些证明材料可以包括购货合同、付款凭证、进货发票复印件、增值税专用发票复印件等。通过这些证明材料，企业可以证明其在购买商品或接受服务时的真实性与合法性，并提供给税务机关进行查验。
需要注意的是，以上处理措施适用于纳税人按照法定期限进行税收申报与缴纳的情况。对于销售方或服务提供方无法提供补开增值税专用发票的情况，企业可以申请增值税专用发票抵扣联丢失的税款追缴。具体流程可咨询当地的税务机关，获得准确指导。
在处理增值税专用发票抵扣联丢失的过程中，企业应积极与税务机关和销售方或服务提供方合作，尽力确保抵扣权的合法性和合规性。同时，企业需要加强内部的发票管理，确保增值税专用发票的安全性，防止抵扣联丢失的情况发生。
总结起来，当发生增值税专用发票抵扣联丢失时，企业可以通过及时补开增值税专用发票、记录归集丢失发票并提供相关证明材料备查等措施来处理。合理合规地处理这一问题，有利于企业保持正常的抵扣权益，避免因丢失发票而产生的不必要的损失。
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