《名侦探柯南》剧情主线
【本剧情主线采用不同颜列出《名侦探柯南》相关集数的作用】

1黑暗组织成员出场集数，采用红标注；

2重要人物出场与重大事件发生的集数，采用绿标注；

3主要人物出场集数，采用黑标注；

4与主线无关但精彩的集数，采用蓝标注；
5但凡其它特别说明，采用各星号◆标注。
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1 云霄飞车杀人事件（柯南主要人物登场，黑暗组织成员琴酒和伏特加初登场。元太、光彦、步美初登场）
2 董事长千金事件（第1集的情节延续，工藤新一变成柯南）
3 偶像密室杀人事件（冲也洋子初登场，外加新兰情感花絮，主要在末尾。‘沉睡的小五郎’首次出现。柯南获得蝴蝶领结变声器）
4 大都会暗号地图事件 （少年侦探团成立，开始首次办案。最重要的是最后步美亲上了柯南哦！）
5 新干线大爆破事件 （遇上了两个疑似琴酒和伏特加的男子，却是虚惊一场。柯南获得脚力倍增运动鞋和装有窃听器的眼镜）
◆动画原创6
情人节杀人事件 （铃木园子初登场。柯南获得手表型，毛利大叔开始第一次中麻醉针沉睡‘破案’）
7 每月一件礼物威胁事件 （小兰首次怀疑柯南的身份）
9 天下一夜祭杀人事件（琦玉县横沟警部初登场）
10 职业足球选手威胁事件（新一与小兰情感花絮，重磅推荐。柯南获得便当型携带传真机）
◆特别篇11 月光奏鸣曲杀人事件（很精彩的TV版首个特别篇）
12 步美事件 （超搞笑的一次案件，内含步美对柯南的……，外加光彦和柯南之间关于结婚的对话。少年侦探团获得侦探徽章，柯南获得双涡轮引擎滑板）
13 奇怪的寻亲杀人事件 （柯南的眼镜升级为犯人追踪眼镜，宫野明美登场）
18 六月新娘杀人事件 （松本警视厅长初登场。继毛利小五郎后，原子开始了她的初次推理）
20
鬼屋杀人事件 (柯南获得伸缩背带)
◆动画原创21
电视剧外景队杀人事件 (TV早期的动画原创很多都是不错的，这一集情节紧凑，在案情推理方面处理得很好，值得推荐)
22-23
豪华客轮连续杀人事件(上)(下)
(不错的一次案件，推理也极其精彩，值得推荐)
27-28 小五郎同学会杀人事件(上)(下)（毛利难得的清醒推理）
32 咖啡店杀人事件（妃英理初登场）
34-35 山庄绷带怪人杀人事件(上)(下) (本次案件是柯南早期中非常精彩的一次案件，非常值得观看。)
43 江户川柯南诱拐事件（工藤新一父母初登场）
48-49 外交官杀人事件(上)(下)（服部平次初登场，柯南第一次变回新一）
54
电玩公司杀人事件（黑衣组织成员龙舌兰出场，关于酒名与成员名的重要线索剧情）
57-58 福尔摩斯迷杀人事件(上)(下)（服部平次第二次登场，并且知道柯南身份）
◆76 柯南对怪盗基德（怪盗基德初登场，很精彩。搜查二课茶木神太郎警视初登场，话说这位警官的第二次登场要到六百集以后了；搜查二课中森警部初登场）
77-78 名门连续惨死事件(上)(下)（服部平次第三次登场，开始与柯南合作破案）
◆96 走投无路的名侦探--连续两大杀人事件 （新一父母第二次出现，柯南差点被小兰识破，马县山村刑事初登场）
100-101 初恋情人回忆事件(上)(下)（新一与小兰的情感花絮）
112 帝丹小学7大不可思议事件（案情与主线无关，不过很有搞笑性）
114-115 有氧潜水杀人事件(上)(下)（毛利小五郎与妃英理的情感花絮）
116-117 推理小说家失踪事件(上)(下)（服部平次出现的集数）
◆特别篇118 浪花连续杀人事件（远山和叶及其父亲初登场，案情很精彩）
128 黑衣组织10亿元抢夺事件 （关于黑暗组织很重要的一集，宫野明美死亡）
129 来自黑衣组织的女子（大学教授杀人事件，灰原哀初登场）
130-131 竞技场无差别胁迫事件(上)(下)（灰原的一句话，新一与组织半个世纪前的联系？以及结尾处她突然冒出来的一句关于时间的高深之言，这话同309-311 同黑暗组织的接触相关联）
◆132-134 魔术爱好者杀人事件（怪盗基德第二次登场）
136-137青古城探索事件(上)(下)（灰原与步美就柯南归属问题进行了交谈）
141-142 结婚前夜的密室事件(上)(下)（柯南与服部再次合作办案）
146-147 本厅刑事的恋爱故事1 (上)(下)（高木警官与佐藤的感情戏，白鸟警官初登场）
153-154 园子的夏日海滩冒险物语(上)(下)（京极真初登场，原子的感情戏）
156-157 本厅刑事的恋爱故事2 (上)(下) （高木警官与佐藤的感情）
◆162 空中的密室&工藤新一首次推理 （工藤新一在侦探界粉墨登场，第一次办案）（和286-288工藤新一NY事件相承接）
◆166-168 鸟取蜘蛛屋的怪物（服部平次相关案件，也是TV中早期蛮精彩的一次案件）
170－171 黑暗中的死角杀人事件(上)(下) （新一与小兰，毛利与妃英理的情感花絮。新出医生初登场。案情初看没什么，却为345与黑衣组织直面对决埋下了大伏笔！！！）
◆特别篇174 二十年后的杀机（法律追溯期最早是在这里学到的，非常精彩的一部特别篇）
176-178 与黑之组织的再会（黑暗组织重大情节进展，组织成员贝尔摩德初登场)
180-181 红的杀机夜想曲(上)(下)（内有少许情感花絮，结尾处)
◆特别篇184 诅咒假面的冷笑 (动画原创的特别篇，非常精彩，重磅推荐！)
188-193 性命交关的复活系列篇章（TV版首个长篇系列，案情曲折精彩，内含柯南、新一与兰的情感花絮）
194-195 意味深长的音乐盒(上)(下)（性命交关的复活系列篇章的后续交代）
199-200 嫌疑犯毛利小五郎(上)(下)（妃英理为毛利首次解围）
205-206 本厅刑事的恋爱故事3 (上)(下)（感情戏）
212-213 蘑菇，熊与侦探队(上)(下)（光彦对灰原有一点点动心）
217-218 目暮警官尘封的秘密(上)(下) （目暮警官过去的恋爱，很令人同情哦）
◆特别篇219 被召集的名侦探！新一对怪盗基德（7个名侦探聚会，怪盗基德的过去，白马探初登场）
220-221 充满谎言的委托人(上)(下)（服部平次母亲初登场）
222-224 人鱼失踪记（情节与上集有关系，服部和叶登场，平和感情戏，关键词长生不老，游客花名册上有宫野志保的名字）
226-227 战斗游戏的陷阱(上)(下)（神秘英语老师初登场）
228-229 充满杀意的陶艺教室421事件是什么意思(上)(下)（新一与小兰情感花絮）
230-231 谜一样的乘客(上)(下) （神秘男子初登场）
233-234 无法消灭的证据(上)(下) （内有对 230-231谜一样的乘客 最后的一点交代)
238-239
大阪的3个K事件(上)(下) （服部平次出场案件，内有柯南对于案件的个人情感）
240-241
新干线护送事件(上)(下) （剧情与上集链接，新一与兰，高木和佐藤的感情戏）
242 元太少年的灾难（案情与主线无关，最后柯南知道了琴酒是左撇子）
253-254 本厅刑事的恋爱故事4 (上)(下)（感情戏，神秘男子二度登场）
258-259 来自芝加哥的男人(上)(下)（神秘男子三度登场，以及来自芝加哥的神秘男子初登场）
◆特别篇263 大阪双重神秘浪花剑士和太阁之城（不错的特别篇）
◆动画原创264-265 法庭的对决 妃VS小五郎(上)(下) （妃英理法庭表现，很不错）
266-268 情人节的真相（新一与小兰，原子与京极真的情感花絮）
269-270 犯罪的纪念品(上)(下)（神秘男子相关）
271-272 急忙掩饰的忽略(上)(下)）（神秘英语教师相关）
274-275 幽灵公寓的真相(上)(下)（新出医生再次出场集数，此两集的重点要到后面才能明白，此新出医生已非彼新出医生了）
277-278 英语教师VS西部名侦探(上)(下)（神秘英语教师相关，身份越来越可疑）
284-285 中华街雨中的似曾相识(上)(下) （横沟警官的弟弟初登场，傲气十足。柯南与小兰情感花絮，为286-288提供开端）
◆286-288 工藤新一NY事件（工藤新一出场案件，关于神秘男子的一点过去）（承接162 空中的密室&工藤新一首次推理）
291-293 孤岛的公主与龙宫城（服部和叶与柯南小兰感情戏）
◆动画原创297-298法庭的对决Ⅱ 妃vs九条(上)(下) （妃英理相关案件）
301-302 恶意和圣者的行进(上)(下)（佐藤与高木的感情戏，为304 震动的警视1200万人质埋伏笔)
◆特别篇304 震动的警视厅 1200万人质（佐藤尘封的感情记忆，酸楚的过去，人气角松田阵平登场）
305-306 看不见的嫌疑犯(上)(下)（毛利小五郎难得又一次清醒推理)
307-308 无声的证据(上)(下) （为309-311提供背景资料） （也与54 电玩公司杀人事件相连接）
309-311 同黑暗组织的接触（黑暗组织情节重大进展)
312-313 夕阳染红的女儿节人偶(上)(下)（关于灰原哀的父母的过去，以及步美的表白）
◆323-324 服部平次走投无路(上)(下)（服部对和叶的生死告白）
325-327 火焰中的红马 （服部与柯南联合办案，不错的案子)
329-330 金钱买不到的友情(上)(下)（步美与灰原的双边关系达到新的高度。开头博士提到了灰原的父母）
◆333-334 相似的公主(上)(下)（妃英理与工藤有希子正面交锋，还牵扯到了毛利小五郎)
335-336 东都显影所的秘密(上)(下) (工藤有希子继续出场，追踪者神秘男子步步紧逼)
338-339 四辆保时捷(上)(下)（紧逼者带来的疑惑，各方势力孰善孰恶）
340-341 厕所里隐藏的秘密(上)(下)（灰原哀的一点点过去，其父母的一点交代）
343-344 便利店的陷阱(上)(下)（小兰发现了神秘英语老师的一点点秘密，各方势力开始行动）
345 与黑衣组织直面对决 满月之夜的二元推理（自性命交关的复活系列篇章后最重大的情节进展，吐血推荐，把各方神秘势力带给大家的疑惑都一一解答，真是峰回路转。为了更好的欣赏本集，前期埋下伏笔的集数都要看过）
346-347寻屁股上的印记(上)(下)（案件本身不是重点，不过案件中步美的表现给了灰原
决心，作为345重大事件的后续，值得观看。）