优化
1在优化时采用Scf(tight)的选项，增加收敛的标准。再去计算频率。如果
还有虚频，参见下一步。
2. 对称性的影响，很多情况下的虚频是由于分子本身的对称性造成的。这样，
在优化时，如果必要，要将对称性降低，还有，输入文件有时是用内坐标。
建议如果有虚频的话，将内坐标改成直角坐标优化。
3.如果上述方法还有虚频，看一下虚频，到强度较大的，将在频率中
产生的原子的振动坐标加到相应的输入文件中。这样，重新计算。直到
虚频没有。
4 实际上，如果分子柔性较大，很难到最低点，这是电子结构计算的问题，
这种情况下，需要动力学的 东西，用构象搜寻的办法解决。
如：模拟退火，最陡下降法，淬火法等。将得到的能量最低的构象做
一般的电子结构计算，这样，应当没有问题。
不要讲你还没有得到最稳定的结构，那么，是你的分子有问题，
要么计算错了，要么就是游离出现代计算的范畴
1。低频率振动模式时，力常数很小，必须使用opt＝tight以确保适当的收敛和随后任务步骤中频率计算的可靠度。
比如我曾经算过一个体系，第一个频率振动的力常数只有10～20，很不放心，加入tight后，优出来的结构却与前面大相径庭，而且还出现了一个虚频。
2。做IRC计算的时候，如果步长很小，必须要用verytight。就曾有人步长设为1，而不加verytight，算出来的反应路径是v字形倒海鸥状的。
3。使用int指定用于数值积分的积分网格来用于消虚频的时候，必须注意，在比较能量的时候，对所有的计算要使用相同的积分网格。
检查错误
1． 检查是否有初始文件错误
在命令行中加入 %kJob L301 or %kJob L302
如果通过则一般初始文件ok。
常见初级错误：
a. 自旋多重度错误
b. 变量赋值为整数
c. 变量没有赋值或多重赋值
d. 键角小于等于0度，大于等于180度
e. 分子描述后面没有空行
f. 二面角判断错误，造成两个原子距离过近
g. 分子描述一行内两次参考同一原子,或参考原子共线

2． SCF(自洽场)不收敛
则一般是L502错误
省却情况做64个cycle迭代(G03缺省128 cycles)
a. 修改坐标，使之合理
b. 改变初始猜  Guess=Huckel 或其他的，看Guess关键词。
c. 增加叠代次数 SCFCYC=N （对小分子作计算时最好不要增加，很可能结构不合理）
d. iop（5/13=1）这样忽略不收敛，继续往下做。
3． 分子对称性改变
a. 修改坐标，强制高对称性或放松对称性
b. 给出精确的、对称性确定的角度和二面角。 如CH4的角度给到109.47122
c. 放松对称性判据  Symm=loose
d. 不做对称性检查 iop(2/16=1) （最好加这个选项）
     iop(2/16=2) 则保持新的对称性来计算

4． Opt时收敛的问题
a. 修改坐标，使之合理
b. 增加叠代次数optcyc=N

5． 优化过渡态，若势能面太平缓，则不好到。
iop(1/8=10) 默认30（下一个结构和该结构的差别0.3Å），可改成10。如果每一步都要用到小的步长，应该加opt(notrustupdate)

6． 在CI（组态）方法中
如QCISD(T),CCSD(T),CID方法中，省却最大循环50，若出错（L913错误）
解决方法：#P QCISD(maxcyc=N)    注：N≤512

7． 优化过渡态
opt=TS (给出过渡态) 
opt=qst2 (给出反应物和产物) 
opt=qst3 (给出反应物和产物和过渡态)
a.  用G03时的出错  opt=ts 必须加FC (force constant)
写法：opt=(TS, calcFc)
or    opt=(TS,calchffc)计算HF力常数，对QCISD，CCSD等方法用；
or    opt=(TS,modRedundant)  (最好写这个)
b. 如果计算采用QCISD计算（不好计算FC）
则写为QCISD opt=(TS, calcHFFC) (用HF计算FC)

8. 无法写大的Scratc件RWF
a. 劈裂RWF文件 %rwf=loc1,size1,loc2,size2,……..,locN,-1
   b. 改变计算方法 MP2=Direct可以少占硬盘空间
   c. 限制最大硬盘 maxdisk=N GB，****MB,有些系统写2GB会出错，可以写2000MB

9. FOPT出错 原因是变量数与分子自由度数不相等。 可用POPT 或直接用OPT

10. 优化过渡态只能做一个STEP 原因是负本征数目不对 添加 iop（1/11）=1或者noeigentest

过度态优化
1.首先遇到的问题是，用哪种方法来寻过渡态？
  GAUSSIAN提供的方法是QSTN和TSN方法。两种方法各有优点和缺点。QSTN方法特别QST3方法要求输入反应物，过渡态的猜测结构，产物这三者的结构。特别麻烦。但很管用，一般不会出现不收敛的情况。对于TSN（对应关键词为OPT=TS）方法，只要求输入过渡态的初始结构，但这个初始结构非常的关键，如果结构不好，则很容易出现不收敛的
情况。所以我建议，如果是刚开始做过度态的话，用QSTN方法是好的选择，等有了“感觉”之后，再用TSN方法。
   2. 怎么解决经常出现的错误？
  在过度态的时候，经常碰到的一些问题就是不收敛（1）.，有一个错误的本征值（错误信息为：there is a wrong sign eigenvalue in )（2），和LINK9999错误导致退出。（3）
   对于不收敛的情况，可以分为两类，比如提示信息里的CONVERGENCE FAILER 提醒收敛到了10（-5），而此时你设定的SCF循环次数也仅仅是64步，那么完全有希望通过加大SCF循环次数来达到收敛的目的。倘若只收敛到10（-3）或10（-2），此时加大循环次数可能就没用了。结果还是CONVERGE FAILER。 此时可采用SCF=QC，来达到强制收敛的目的 。因为SCF=QC（LINK508）的计算量比默认的L502要大，所以不到万不得以就不用它了。多一点就不准
   出现第二个错误可以直接用 关键词OPT=NOEIGEN 来实现。
   LINK9999出错是因为已经走完了默认的步数，但还未完成。系统会自动跳出。出现这种情况大多数就是因为优化步数和SCF步数超过了默认值。可用OPT（MAXCYCLE=100）
和SCF（MAXCYCLE=300）来改错。
   3.怎么样控制过渡态的优化，使得过渡态不至于收敛到其他的分子结构中去？
   我用GAUSS VIEW 可以解决这个问题 ，当刚开始运行GAUSSIAN时，你用GVIEW去打开输出文件时，你可以看到你的过渡态的初始输入结构，当一个循环过后（从上一个LINK502到下一个LINK502），你再打开输出文件，你就可以清晰地看到优化一步后分子的构型，这样就可以随时监控过度态分子的结构，倘若已经有收敛到其他分子构型的趋势时，你就可以把它给KILL了，而不至于需要等全部工作结束后，打开输出文件才知道已经不是想要的过渡态了。 如果收敛到其它的构型上去，可以考虑缩小OPT的步长.iop(1/8=2或3）即可。
   4.  还需要加其它的关键词吗？
    建议在OPT中加入CALCFC。这样可以加大到过渡态的几率。本人深有体会！
   先写这么多了，难免有错误和不恰当之处，还希望大家来指点和补充！
虚频
首先，什么是频率。
中学的时候我们学过简谐振动，对应的回复力是f=-kx,对应的能量曲线，是一个开口向上的
二次函数E=kx^2/2. 这样的振动，对应的x=0的点是能量极小值点（简单情况下也就是最小值点）。这时的振动频率我们也会求：ω=2π sqrt(k/m)。显然它是一个正的频率，也就是通常意义下的振动频率。

那么，一维情况下，如果能量曲线是一个开口向下的二次曲线呢？首先，从能量上看，这是个不稳定的点，中学的物理书上称为“不稳平衡”。用现在的观点看，就是这一点导数是零（受力为0），且是能量极大值。如果套用上面的公式，“回复力”f=-k'x（实际上已经不是回复，而是让x越来越远了），这里k'是个负数，ω=2π sqrt(k'/m)显然就是一个虚数了，即所谓的虚频。Gaussian里面给出一个负的频率，就是对应这个虚频的。

实际情况下，分子的能量是一个高维的势能面，构型优化的时候，有时得到了极小值点，这样这个点的任意方向上，都可以近似为开口向上的二次函数，这样这里对应的振动频率就都是正的。对于极大值点，在每个方向都是开口向下的二次函数，那么频率就会都是负的——当然一般优化很少会遇到这样的情况。对于频率有正有负的情况，说明到的点在某些方向上是极大值，有些方向上是极小值。如果要得到稳定的能量最低构型，显然需要
通过微调分子的构型，消去所有的虚频。如何微调？要看虚频的振动方向。想象着虚频对应的就是开口向下的二次函数，显然，把分子坐标按照振动的方向移动一点点，分子应该就可以顺着势能面到新的稳定点，但是也不能太小。而所谓的过渡态，则是连接反应物和产物之间的最低能量路径上的能量极大值。好比山谷中的A，B两点，它们之间的一个小土丘，就是过渡态，从A到B的反应，需要越过的是这个小土丘，而不是两边的高山。这样，过渡态就是在一个方向上是极大值，而在其它方向上都是极小值的点。因此，过渡态只有一个虚频。
IRC
在%section部分加上 %chk=保存文件名
其他的与一般输入的一样就可以啦