酒曲制作鸡粪是廉价的低能饲料，特别是在现代蛋白质饲料昂贵而能源饲料较贱的情况下，用鸡粪代替部分蛋白料，不仅补充了能源饲料,而且大大提高畜牧养殖业的经济效益，减少污染，净化环境。用鸡粪饲喂反刍动物，其蛋白质的消化率则高得多，因为瘤胃微生物能利用鸡粪中的有机酸(约占35%)作能源，将动物所不能利用的粗蛋白变为可利用的菌体蛋白质。目前鸡粪的发酵方法有以下几种:
一、自然青贮发酵法 该法的原理和制作与常规青贮方法相同。鸡粪青贮容器可采用缸、池或者青贮塔等。
配方一：先把鸡粪70%、草料或秸秆粉20%、糠麸10%，按比例混合好，其水分含量达60%左右(用手握料见水迹而不滴水珠)，然后放入池(窖)内踏实、密封4～6周即可。青贮发酵后鸡粪形状似黄酱，颜黄绿，具有酒糟味，能增加适口性。此法加工鸡粪，经病理检疫，未发现致病菌。
配方二：将新鲜鸡粪与麸皮按3∶2比例或与碎大麦粒各半混合，水分控制在50%左右装入青贮
窖内，密封发酵，温度保持在5℃以上，20～40天后可开窖使用。这种青贮料与秸秆和干草等混拌饲喂，适口性好。
配方三：鸡粪垫草混合青贮：利用垫草收集鸡粪前就应将垫草铡成5厘米左右长度，把垫草和鸡粪混合物直接青贮发酵后喂牛。但需注意所选用的垫草种类和数量应适合牛的需要。
配方四：日本资料介绍的鸡粪青贮发酵法：把鸡粪(半干鸡粪较好)、青草、豆饼、米糠和颖壳(促进发酵)，按比例配合装入缸中，盖上缸口，压上石头进行乳酸发酵，经历3～5周便可使用。调制好的这种饲料，适口性和吸收率都有提高，适宜饲喂成鸡、育肥猪和繁殖母猪。
二、加曲发酵法 襄樊市生物化学研究所从鸡场霉变鸡粪中分离筛选出一株适宜发酵鸡粪的P2菌株，初步鉴定为米曲霉，经测定不产黄曲霉毒素B1。该所用此菌株制曲，每克干曲含孢子55～60亿，曲呈黄，发酵力强。用这种曲发酵鸡粪，其产品气味纯正，无异臭味，粗蛋白含量达29%以上，还原糖增加3.5%以上，游离氨基酸总和增加3.5倍。饲养试验证明，用30%的此种发酵鸡粪育肥猪，猪生长快，抗病力强，肉料比为1∶3.34，与全喂配合饲料猪的肉料比1∶3.40，差异不显著(P>0.05)。新鲜鸡粪70%、麸皮10%、米糠15%加酒曲粉5%，掺水适量，充分拌匀，入窖(池、缸)密闭发酵48～72小时，即可饲喂。
应当注意的两点：第一，要注意鸡粪(连同铺垫如稻草、木屑等)的含水量最好保持在32%～38%。水分太高会变得太酸，水分太低发酵不能正常进行。因此，鸡粪装入前要测定含水量，水分不足要适当添加；水分过高可加糠麸调节。第二，发酵时间因气温而异，在温带、亚热带地区一般冬季需3个月，夏季需1个月。发酵情况可通过测量其内部温度来判断：发酵开始时，由于细菌活动产热，温度可逐渐上升，内部温度最高可达83℃左右，以后就不再上升。当内部温度与外界温度相等时，证明发酵停止，即可开窖，取出鸡粪使用。
三、鸡粪的EM菌液发酵法 鸡粪的收集：为便于鸡粪的清，在鸡舍笼架下用麦麸、米糠或草粉做垫料，垫料与鸡粪的比例大致为3∶2，使鸡粪与垫料的混合物水分含量在35%左右，所收集的鸡粪必须是无疫鸡的新鲜鸡粪，以当日清理发酵效果最好，夏天最迟不得超过3日，冬天不得超过5日。长期饲喂大剂量添加剂的鸡粪，使用EM发酵处理效果较差。
EM菌液的用量及配制方法：按500公斤鸡粪垫料混合物，400毫升EM菌液，400克红糖的比例进行配合，具体操作方法是首先确定要处理鸡粪的量，并按比例算出EM菌液和红糖的用量，用少量50℃左右的温开水把红糖溶解，然后加适量冷开水稀释，随之加入所需EM液，并按处理鸡粪及垫料量的5%加足清水，混匀待用。
鸡粪的EM发酵处理：将清理的鸡粪分层装入发酵池内，小型鸡场可用缸处理，每层20厘米厚，每装一层按比例均匀喷洒EM稀释液，发酵鸡粪及垫料的水分含量一般在40%左右，每加20厘米厚的一层鸡粪，按比例喷洒EM稀释菌液一次，重复操作，直至贮满，用塑料布密封发酵。EM发酵鸡粪的直观检验：在常温情况下，鸡粪的EM发酵夏天只需3天，冬天需5～7天即可发酵完成。经EM菌液发酵后的鸡粪，酸香味取代了臭味，敞开塑料布，发酵鸡粪表面有白菌丝覆盖，即认为发酵成功，可用于饲喂奶牛。
鸡粪中有撒落的鸡羽毛，对牛瘤胃有伤害，加工过程中特别注意清理鸡粪中的羽毛等。
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