——Chapter 1 あらしのうみで（暴风雨的大海中）——
巨大的风雨声中：
“没事吧……别说话……再坚持一下……只……只能到此为止了吗……啊！”
带着怒涛的闪电中，一道闪电落下，眼前是一个奇形怪状的岩石……
一日，美丽的海滩上，主角缓缓地张开了眼睛，这里是什么地方？可是一阵眩晕袭来，又失去了知觉……
这天傍晚，搭档来到了胖可丁的行会门前，正当他鼓足勇气想要进去的时候，突然脚下传来一声大叫：发现怪兽！发现怪兽！这下可把它吓坏了……看来不行啊，搭档失望地看着自己好不容易带来的宝贝——一个被它捡到的刻着神秘花纹的“遗迹的碎片”，不过看来没指望了……转身离去的搭档背后，出现的却是——瓦斯弹和超音蝠？看来他们对搭档拿来的这个“宝贝”产生兴趣了……
来到沙滩的搭档望着远处的夕阳美景（沙滩旁边的空气里哪来的那么多气泡，这大闸蟹也太能耐了吧……），突然，他发现了倒在岸边的主人公！好心的搭档匆忙来到主角身边把他叫醒，并进行了自我介绍，可当他听说主角说自己是人类的时候吓了一跳！不过，这副样子的人类？？啊！这时主角终于发现了自己已经变成了怪兽的样子！不过自己的名字总还记得吧～
◎输入主角姓名
正当搭档向刚刚的误会表示歉意时，突然背后来到的瓦斯弹和超音蝠茬来了！该死的他们竟然把搭档最重要的宝物抢走了。呃，当然不能就这样算了！搭档问起主角能否帮助自己，当然要出手了！
迷宫一 かいがんのどうくつ（海岸的洞穴）
层数：5F
道具：钱，果实，爆炸种子和睡眠种子
BOSS：超音蝠+瓦斯弹
主要怪兽：大舌贝（经验值很低），太阳珊瑚，海蜗牛，化石盔（会提升防御）
突破要点：主角一开始就是LV5，很简单的迷宫，上手用的，所以以熟悉操作和熟悉菜单以及系统为主，顺便可以练个一两级；本迷宫只能带一个道具，而且身上本来就有一个回复HP用的果子，该用就用掉吧；最后提示一些迷宫新玩家——按住R以后可以斜向移动、按X打开菜单，第一项是技能，对某项技能按A选择“とうろく”以后，L+A是使用技能攻击，能造成大伤害并且消耗PP值，平时直接按A是普通攻击、迷宫里的绿箭头是回复因敌人技能而下降的能力的。最后身上最好剩一个HP道具来对付BOSS。
通过4F后，到达底层，果然到了两个坏东西，搭档终于鼓起勇气大声让他们还回自己的宝贝，可是他
们哪里肯！OK，既然不愿意，用战斗来解决！建议先两人合力对付攻击力较高的瓦斯弹，然后再解决超音蝠。
战败的二人交出了遗迹的碎片就匆匆走掉了，哈，丢
人！幸福的搭档终于露出了笑容。
在海岸边，搭档开始给主角讲述遗迹碎片的来历和自己那遥远的探险梦想……充满了美好愿望的搭档突然问道，你是不是也想一起去探险呢？哈，不忍心让他失望，答应他吧！二人探险队，正式结成！
◎至此，游戏第一次记录！
——Chapter 2 ギルトにゅうもん（行会入门）——
两人来到一个造型独特的建筑前——这里就是胖可丁的行会了，搭档介绍说——如果要组成探险队的话，首先需要在这里登录～不过似乎不知道为什么每次一到这里都会非常紧张，所以感觉怪怪的……果然，他刚走过门口，又有声音大叫起来：发现怪兽！还能分辨出是小火猴？可是主角一站上来，那声音却变得含糊了起来，看来不认识呢……哈，往下一看，原来是行会里负责看门的地鼠～这次对新来的主角的脚印也判断不准了呢～门终于开了，进去吧！来到位于地下的行会，哇，这里好热闹！身为行会会长胖丁的大弟子音符鹦鹉前来和两人打招呼～以后就由他来照顾主角他们了，不过呢，想要集成探险队
的话还是要先经过修行的～带着两人来到地下二层老板胖可丁的部屋，OK，先进行队伍的登记吧！——顺便说一声，胖可丁老板的说话方式非常搞笑，经常吓人一跳，而且每次它出场都有让人发笑的背景音乐响起……
◎输入队伍名称
登录完毕后，胖可丁把ポケモンたんけんたいキット（口袋探险队装备）交给了主角他们，啊，探险队必要品获得——探险队徽章、不可思议地图、宝物袋，另外，胖可丁还会给主角两个特别的道具——キトサンバンダナ、ブルーリボン（这个道具不一定就是这两种，可能是随机种类，请自行测试）接下来终于来到了主角自己的房间……呃……和前作比真是太糟糕了……两个草堆……估计还不能像前作一样进化……
◎此后，每次进入主角房间在床上（草堆上）即可进行记录。
第二天一大早，还是昏昏沉沉的主角就被巨大的叫喊声叫醒了，原来是行会里负责叫人起床的重音怪：你们到底要睡到什么时候-～！！！！已经过了集合的时间了，大家已经都到场了，胖可丁出来稍微交代了一下当天的任务就可以自由行动了。刚没走两步，又被音符鹦鹉叫住，这次要介绍的是行会的委托揭示板，顺便给主角们个活干干吧！——来自弹簧猪バネブー的委托，据说它的珍珠丢失了，拜托主角们能帮它个替代的……OK，不用多说了，走吧！
迷宫 しめったいわば（潮湿岩场）
层数：7F
道具：种子，石头，苹果，果实，豆类
BOSS：无
主要怪兽：海蜗牛，化石花，化石虫，铃铛怪
突破要点：海蜗
牛，化石花和化石虫能够在水里移动；铃铛怪的缠绕比较烦人，而且HP还多，最好用技能打。
到达7F获得珍珠，回到行会，委托完成～收到谢礼（如果收到谢礼时身上道具已满，就需要扔掉一些），另外还有礼金哦～不过居然会被音符鹦鹉收走一部分，说是行会规定……接下来就是欢乐的晚餐时间了～深夜，搭档想起了今天一天帮助别人的乐趣……
——Chapter 3 じくうのさけび（时空的呼唤）——
次日清晨自然又是一如既往地被叫醒，那么今天要知道的是？音符鹦鹉介绍了右边的委托栏以后就叫来
了行会里地位最低的龅牙狸，看来他对晚辈的到来以及自己终于也有了后辈非常的感动呢……OK，参观一下行会内部的设施吧——毒蟾斗士的交换所，餐厅，会员的房间，以及老板的房间；接下来就到旁边的宝物镇去看看吧！夜游鬼的银行，狂电兽的技能连结屋，变龙兄弟的商店，袋龙的仓库，介绍完毕后就可以自己去对话试试各个设施的用途了～最好把在上个迷宫捡到的过剩道具存在这里一些。
在变龙商店刚买完东西（买不买都行，去对话一下），会发生玛莉路和路丽丽剧情，变龙兄弟很有意思的兄弟剧情呢～正当主角帮路丽丽拣起摔倒时掉落的苹果时，突然——主角感到眼前一道闪光划过，是谁在喊救命？瞬间而过的记忆……可是眼前的其他人却毫无知觉……到底？来到右边的广场……和露丽丽以及擦肩而过的素利普告别后，奇怪的感觉又出现了，不过这次主角看到的景象竟然大吃一惊——被认为“亲切”的素利普在威胁着露丽丽！不过搭档却认为这只是主角想象的错觉而已，真的吗……
回到行会一层，到龅牙狸前辈，冒险准备OK，来看看有什么委托吧！突然间发生了巨大的振动！原来是负责信息更新的三地鼠弄出来的……更新完毕，可是，搭档却直盯盯地看着揭示板的内容战抖了起来，怎么了？天啊，刚才被说的“很亲切的素利普”竟然成了通缉犯？！露丽丽有危险了！果然，刚出行会就看到了着急的玛莉路，好了，一切都知道了，出发吧！
迷宫 トゲトゲやま（荆棘山）
层数：10F
道具：玉，果实，投掷类道具，
BOSS：素利普
口袋怪兽绿叶版攻略主要怪兽：小拳石，绿蜘蛛，腕力，卷毛翁，嘟嘟利，尼多厉娜，尼多力诺，
突破要点：嘟嘟利在HP少时会逃跑；这里的怪兽普遍HP比较多～
正当素利普逼迫露丽丽到小洞里的时候，主角出现了！不过搭档似乎又胆怯了……被素利普瞧不起可不行，开战！素利普的HP大概在100左右，多用技能来对付～
打败了素利普，剩下的就交给这里的警察飞碟磁怪吧！露丽丽也回到了哥哥玛莉路身
边～收到礼金也是一如既往地被上缴了90%……不过，主角为什么会在事情发生前就能够神奇地预料到即将发生的一切呢？哈，肚子才是解决问题的关键，又是快乐的晚餐时间了～
这天晚上，电闪雷鸣……这时，搭档想起来主角出现的前一天晚上也是这样的雷电天气……可是，失忆的主角还是什么都想不起来……这天晚上，搭档说起了这个世界的一种独特的物品，时之齿轮的事情……森林中，水中，火山上……就在这个风雨交加的夜晚，一个黑影出现了！“这就是时之齿轮嘛？哼哼……”
次日，听完胖可丁交代的工作以后就可以自由行动了～今天的工作是完成委托！
◎操作方法：到行会地下一层左边或右边的看板——左边是普通委托，类似于人送东西之类的，后边的一般是战斗委托，难度相对大一些，而获得的点数一样，所以还是推荐做左边的任务……按A调查，选择第一项“けいじばんをみる”/“おたずねものポスターを　みる”，会显示任务的名称和难度级别，按A接受，然后按B退出，再选择第二项“いらいリスト”（或者在未调查时按X打开游戏菜单选择该项），对该信件按A，选择“じっこう”，这时委托会变成信封开启的状态，同时上屏会显示出具体的任务信息，然后退出，控制主角走出行会，向下走，在城镇交道口处向右出村，这时应该有一个迷宫前有一个开启的信封模样，表示你的委托在这个迷宫完成，如果没有的话请检查上面的步骤是否已经完成（即委托是否已经接受），前往该迷宫，到达指定层数完成委托即可。
◎提醒：进入迷宫前最好先去整理道具及存放金钱、以及到自己的房间存下档。
接下来一段时间就持续做任务升级探险队的级别吧！
◎探险队级别：按X打开游戏菜单下方就是，和前作一样，需要靠积累点数来升级
——Chapter 4 みはりばん（看守任务）——
完成了几个委托后的一天早上，刚集合完毕，重音怪突然来到了主角们，原来地鼠今日有事，要拜托
主角们来帮忙看门了～原来地鼠的看门任务就是通过向上观察每个人的足迹来辨认来者是什么种类的怪兽，难怪当初会把在门口的搭档吓一跳呢～OK，来试试吧～小游戏，开始！
看门小游戏操作方法：上屏中间出现一个脚印，同时有绿的计时条，计时条减少的同时，下屏上会逐渐出现更多的信息：怪兽名称->怪兽头像->怪兽外形，在绿条全部消失前用触摸点击（双击）对应怪兽，并出这是哪个怪兽的脚印，每次总共猜6只怪兽，根据所花时间以及正确数量可以累计得分。
不过如果做的太差的话……会在结束后被音符鹦鹉很不客气地指
责，重音怪也会暴怒！另外……这天晚上是没有晚饭吃的……直到睡觉前都还会被暴怒的重音怪吓到……所以……努力吧！
接下来继续完成任务，直到出现下一幕——
——Chapter 5 はじめのたんけん（初次探险）——
这天早晨，在集合时音符鹦鹉宣布了一件令大家震惊的事情——一个叫做キザキのもり（木崎森林）的地方的时间停止了！无风云停水珠静止……终于，真相被猜到了，那里的时之齿轮被人拿走了！不过警察飞碟磁怪已经着手调查，所以不用担心了～解散后，音符鹦鹉叫住了主角二人，终于要分配探险队的任务了，激动～激动地搭档再次痛哭流涕～这次是探险新场所，准备出发～来到二层，被风铃怪告知此
后可以招募其他同伴来加入自己的探险队了（其实就是以后可以在迷宫里抓其他怪兽了……）好了，收到了好消息，可以出发了～从城镇向右出发，这时又多了一个前面有感叹号标志的场所“ひみつのたき（秘密瀑布）”，这就是这次探险的目标，走吧！在瀑布前，当两人不知道该从哪里开始调查瀑布时，主角的奇怪的预感又来了……似乎看到谁跳入了隐藏在瀑布后面的洞穴中……那个身影似乎是……好吧，跟着感觉走，123跳！
迷宫 たきつぼのどうくつ（瀑布洞穴）
层数：9F
道具：石头，种子，头巾，臭泥
BOSS：无
主要怪兽：乌波，土鲶鱼，蔓藤怪，蚊香蝌蚪，荷叶蛙，水蜘蛛，可达鸭
突破要点：此迷宫开始出现道具商店，可以带点钱进入以备不时之需；水系为主，蚊香蝌蚪的催眠要小心。
来到底层，一颗巨大的宝石映入眼帘，可是正当搭档使出浑身力气搬起时，主角的预感再次出现——啊，
那个宝石的机关——惨了！一阵激流把两人吹飞到了一个露天温泉处……从地图上一看，居然相隔如此遥远的地方？！
回到行会，向音符鹦鹉汇报了情况之后，主角始终觉得这次记忆里看到的那个身影渐渐地与记忆里的某人重合起来了……啊！没错！就是胖可丁老板！可是当主角拜托音符鹦鹉去询问时，却被胖可丁再次装疯卖傻地糊弄过去了……这晚，搭档突然总结出来，在主角接触到某样东西后，就可以触发神奇的预知的力量！这时，老板让音符鹦鹉来叫他们了。终于，他们也成为行会的一员，并且有可能被选择去进行远征！
——Chapter 6 ドクロース（毒玫瑰队）——
这天解散后正当想要接受任务时，却发现当初抢走搭档宝贝的瓦斯弹和超音蝠出现在揭示板前，并且——他们也是探险队？！他们的大哥终于带着浓重的气味出现了……无理而讨厌的毒玫瑰队终于走了，继续做任务吧。
继续做任务的
过程中会穿插进行看门猜脚印的小游戏，要加油！
又是一天的早晨，正当鹦鹉宣布有新同伴加入大家猜测纷纷时，一股恶臭飘来——为了远征选择的同伴
竟然是毒玫瑰队……看到大家一脸不高兴，胖可丁发飙了……大家好不容易平息了胖可丁的怒气，终于各自办事去了，主角二人也继续办理委托吧～这天晚上开始，饭桌上又多了一个家伙～可是到了半夜，晚饭刚吃饱却又饿了的这三个家伙却开始密谋在行会里吃的……
果然……第二天因为老板的专用食品食料セカイイチ全莫名消失了，主角们被分配到了去セカイイチ的任务——目标直指新地点：リンゴのもり（苹果森林），不过看样子跟在后面来到这里的毒玫瑰队也会来凑凑热闹了……
◎技能连结店及道场开始营业
迷宫 リンゴのもり（苹果森林）
层数：13F
道具：技能训练机，玉，投掷类，豆类，
BOSS：无
主要怪兽：草系虫系怪兽（蓑叶虫，走路草，玫瑰种子，派拉斯特，毽子草，绿毛虫，独角虫，椰蛋树，铁甲蛹，臭臭花）
突破要点：道具似乎不是很容易出现，虽然是苹果森林却没有遍地的苹果……进去前最好带一个苹果备用，水系的要小心，这里大部分怪兽都会吸收类技能。
来到最底层，终于到了长着セカイイチ的树，可是从天而降的竟然是……毒玫瑰队？看来他们打算独吞这里的果实，搭档怎么会允许这样的事情，可正当马上就要开战时，毒鼬王又是一阵臭气扑来……等再睁开眼睛时，セカイイチ全都被带走了……
空手回到行会，任务失败了自然又是被鹦鹉一顿埋怨，唉，今晚的晚饭又没了……胖可丁老板原本以为只是任务失败，觉得无所谓的时候，得知自己喜爱的食物竟然没有了大哭起来，这哭声那叫一个大啊，天崩地裂……正在这时，毒玫瑰队却进来了，冒充好人地把セカイイチ献给了老板，老板一脸高兴地笑了，靠，什么世道……夜晚，超音蝠奇怪地问道，为什么要在那个时候帮那俩家伙？臭鼬王嘿嘿地笑了，为了先弄到行会的信赖啊～而另外一边，搭档也在为白天被毒玫瑰队耍了而懊恼不已……
第二天，本来就饿着肚子的两人又被告知失去了远征的资格，真是倒霉啊……不过，这时好心的同伴来帮他们了，不仅给他们悄悄带来了吃的，还鼓励他们继续努力争取参加远征的资格！有了同伴的鼓励，重新到了信心！再次来到行会大厅，听完毒蟾斗士讲解的交换所的使用方法后，继续去做任务吧！
这天晚上，正当风铃铃再次敲响晚饭的铃声时，音符鹦鹉突然让大家等一下，出什么事了？显然大家对晚饭前说事很不满，原来第二天要公布远征的